又稱為超微結構。指在普通光學顯微鏡下觀察不能分辨清楚的細胞內各種微細結構。(普通光學顯微鏡的分辨力極限約為0.2微米，細胞 膜、內質網膜和核膜的厚度，核糖體、微體、微管和微絲的直徑等均小于0.2微米，因而用普通光學顯微鏡觀察不到這些細胞結構，要觀察細胞中的各種亞顯微結構，必須用分辨力更高的電子顯微鏡。)
能夠在電子顯微鏡下看到的直徑小于0.2微米的細微結構,叫做亞顯微結構。